Наказом ректора Володимира Ісаєнка № 217/од від 22 червня 2020 року відповідно до статті 29 Закону України «Про захист населення від інфекційних хвороб», постанов Кабінету Міністрів України від 20.05.2020 № 392 «Про встановлення карантину з метою запобігання поширенню на території України гострої респіраторної хвороби COVID-19, спричиненої коронавірусом SARS-CoV-2, та етапів послаблення протиепідемічних заходів» (зі змінами), від 11.03.2020№ 211 «Про запобігання поширенню на території України гострої респіраторної хвороби COVID-19, спричиненої коронавірусом SARS-CoV-2» (зі змінами) та від 17.06.2020 №500 «Про внесення змін до деяких актів Кабінету Міністрів України», внесено часткові зміни до наказів № 116/од від 17.03.2020р та № 129/од від 06.04.2020 року.
Відповідно до наказу карантинні заходи в Національному авіаційному університеті продовжено до 31 липня 2020 року.